Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
URB1O60287 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
URB1O60287 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
URB1O60287 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
URB1O60287 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
URB1O60287 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
URB1O60287 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
URB1O60287 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
URB1O60287 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
URB1O60287 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
URB1O60287 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
URB1O60287 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
URB1O60287 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
URB1O60287 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
URB1O60287 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
URB1O60287 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
URB1O60287 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
URB1O60287 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
URB1O60287 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
URB1O60287 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
URB1O60287 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
URB1O60287 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
URB1O60287 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
URB1O60287 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
URB1O60287 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
URB1O60287 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
URB1O60287 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
URB1O60287 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
URB1O60287 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
URB1O60287 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
URB1O60287 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
URB1O60287 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
URB1O60287 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
URB1O60287 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
URB1O60287 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
URB1O60287 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
URB1O60287 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
URB1O60287 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
URB1O60287 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
URB1O60287 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
URB1O60287 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
URB1O60287 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
URB1O60287 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
URB1O60287 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
URB1O60287 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
URB1O60287 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
URB1O60287 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
URB1O60287 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
URB1O60287 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
URB1O60287 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
URB1O60287 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
URB1O60287 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
URB1O60287 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
URB1O60287 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
URB1O60287 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
URB1O60287 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
URB1O60287 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
URB1O60287 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
URB1O60287 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
URB1O60287 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
URB1O60287 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
URB1O60287 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
URB1O60287 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
URB1O60287 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
URB1O60287 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
URB1O60287 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
URB1O60287 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
URB1O60287 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
URB1O60287 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
URB1O60287 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
URB1O60287 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
URB1O60287 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
URB1O60287 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
URB1O60287 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
URB1O60287 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
URB1O60287 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
URB1O60287 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
URB1O60287 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
URB1O60287 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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