Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PLIN1O60240 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PLIN1O60240 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PLIN1O60240 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PLIN1O60240 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PLIN1O60240 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PLIN1O60240 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PLIN1O60240 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PLIN1O60240 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PLIN1O60240 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PLIN1O60240 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PLIN1O60240 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PLIN1O60240 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PLIN1O60240 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PLIN1O60240 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PLIN1O60240 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLIN1O60240 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms