Protein–RNA interactions for Protein: O60232

SSSCA1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSSCA1O60232 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSSCA1O60232 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSSCA1O60232 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSSCA1O60232 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSSCA1O60232 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSSCA1O60232 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSSCA1O60232 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSSCA1O60232 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSSCA1O60232 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSSCA1O60232 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSSCA1O60232 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSSCA1O60232 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSSCA1O60232 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SSSCA1O60232 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSSCA1O60232 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSSCA1O60232 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSSCA1O60232 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSSCA1O60232 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSSCA1O60232 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSSCA1O60232 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSSCA1O60232 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSSCA1O60232 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSSCA1O60232 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSSCA1O60232 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSSCA1O60232 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSSCA1O60232 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSSCA1O60232 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSSCA1O60232 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSSCA1O60232 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSSCA1O60232 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSSCA1O60232 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSSCA1O60232 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSSCA1O60232 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSSCA1O60232 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSSCA1O60232 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSSCA1O60232 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms