Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TRAPPC3O43617 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3O43617 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRAPPC3O43617 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3O43617 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAPPC3O43617 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC3O43617 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAPPC3O43617 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAPPC3O43617 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC3O43617 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAPPC3O43617 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3O43617 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAPPC3O43617 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC3O43617 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC3O43617 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAPPC3O43617 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TRAPPC3O43617 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC3O43617 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC3O43617 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms