Protein–RNA interactions for Protein: O43280

TREH, Trehalase, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREHO43280 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TREHO43280 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TREHO43280 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TREHO43280 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TREHO43280 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TREHO43280 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TREHO43280 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TREHO43280 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TREHO43280 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TREHO43280 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TREHO43280 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TREHO43280 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TREHO43280 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TREHO43280 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TREHO43280 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TREHO43280 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TREHO43280 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TREHO43280 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TREHO43280 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TREHO43280 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TREHO43280 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TREHO43280 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TREHO43280 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TREHO43280 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TREHO43280 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TREHO43280 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TREHO43280 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TREHO43280 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TREHO43280 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TREHO43280 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TREHO43280 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TREHO43280 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TREHO43280 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TREHO43280 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TREHO43280 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TREHO43280 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TREHO43280 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TREHO43280 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TREHO43280 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TREHO43280 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TREHO43280 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TREHO43280 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TREHO43280 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TREHO43280 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TREHO43280 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TREHO43280 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TREHO43280 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TREHO43280 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TREHO43280 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TREHO43280 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TREHO43280 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TREHO43280 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TREHO43280 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TREHO43280 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TREHO43280 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TREHO43280 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TREHO43280 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TREHO43280 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TREHO43280 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TREHO43280 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TREHO43280 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TREHO43280 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TREHO43280 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TREHO43280 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TREHO43280 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TREHO43280 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TREHO43280 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TREHO43280 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TREHO43280 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TREHO43280 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TREHO43280 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TREHO43280 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TREHO43280 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TREHO43280 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TREHO43280 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TREHO43280 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TREHO43280 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TREHO43280 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TREHO43280 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TREHO43280 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TREHO43280 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TREHO43280 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TREHO43280 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TREHO43280 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TREHO43280 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TREHO43280 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TREHO43280 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TREHO43280 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TREHO43280 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TREHO43280 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TREHO43280 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TREHO43280 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TREHO43280 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TREHO43280 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TREHO43280 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TREHO43280 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TREHO43280 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TREHO43280 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TREHO43280 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TREHO43280 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms