Protein–RNA interactions for Protein: O43173

ST8SIA3, Sia-alpha-2,3-Gal-beta-1,4-GlcNAc-R:alpha 2,8-sialyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST8SIA3O43173 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ST8SIA3O43173 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ST8SIA3O43173 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ST8SIA3O43173 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ST8SIA3O43173 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ST8SIA3O43173 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms