Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NUPL2O15504 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUPL2O15504 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUPL2O15504 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUPL2O15504 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUPL2O15504 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUPL2O15504 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUPL2O15504 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUPL2O15504 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUPL2O15504 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUPL2O15504 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUPL2O15504 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUPL2O15504 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NUPL2O15504 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms