Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2DO15399 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2DO15399 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2DO15399 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2DO15399 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2DO15399 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2DO15399 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2DO15399 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN2DO15399 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2DO15399 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2DO15399 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2DO15399 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2DO15399 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2DO15399 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2DO15399 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2DO15399 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2DO15399 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2DO15399 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2DO15399 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GRIN2DO15399 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN2DO15399 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2DO15399 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2DO15399 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2DO15399 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2DO15399 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2DO15399 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2DO15399 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2DO15399 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2DO15399 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2DO15399 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2DO15399 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2DO15399 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIN2DO15399 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms