Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLGNO14967 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLGNO14967 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLGNO14967 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLGNO14967 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLGNO14967 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLGNO14967 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLGNO14967 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLGNO14967 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLGNO14967 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLGNO14967 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLGNO14967 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLGNO14967 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLGNO14967 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLGNO14967 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLGNO14967 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLGNO14967 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLGNO14967 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLGNO14967 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLGNO14967 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLGNO14967 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLGNO14967 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLGNO14967 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLGNO14967 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLGNO14967 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLGNO14967 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLGNO14967 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLGNO14967 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLGNO14967 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLGNO14967 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLGNO14967 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLGNO14967 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLGNO14967 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLGNO14967 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLGNO14967 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLGNO14967 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLGNO14967 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLGNO14967 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLGNO14967 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLGNO14967 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLGNO14967 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLGNO14967 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLGNO14967 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLGNO14967 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLGNO14967 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLGNO14967 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLGNO14967 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLGNO14967 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLGNO14967 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLGNO14967 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLGNO14967 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLGNO14967 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLGNO14967 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLGNO14967 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLGNO14967 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLGNO14967 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLGNO14967 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLGNO14967 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLGNO14967 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLGNO14967 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLGNO14967 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLGNO14967 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLGNO14967 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLGNO14967 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLGNO14967 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLGNO14967 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLGNO14967 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLGNO14967 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLGNO14967 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLGNO14967 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLGNO14967 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLGNO14967 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLGNO14967 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLGNO14967 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLGNO14967 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CLGNO14967 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLGNO14967 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLGNO14967 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLGNO14967 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLGNO14967 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLGNO14967 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLGNO14967 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CLGNO14967 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLGNO14967 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLGNO14967 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLGNO14967 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLGNO14967 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLGNO14967 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLGNO14967 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLGNO14967 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLGNO14967 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLGNO14967 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLGNO14967 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLGNO14967 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLGNO14967 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLGNO14967 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLGNO14967 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLGNO14967 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLGNO14967 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CLGNO14967 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms