Protein–RNA interactions for Protein: O00300

TNFRSF11B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11B, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11BO00300 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFRSF11BO00300 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TNFRSF11BO00300 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNFRSF11BO00300 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNFRSF11BO00300 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF11BO00300 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF11BO00300 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNFRSF11BO00300 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNFRSF11BO00300 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF11BO00300 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF11BO00300 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFRSF11BO00300 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF11BO00300 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFRSF11BO00300 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFRSF11BO00300 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF11BO00300 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFRSF11BO00300 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF11BO00300 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFRSF11BO00300 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFRSF11BO00300 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF11BO00300 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF11BO00300 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF11BO00300 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF11BO00300 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFRSF11BO00300 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms