Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNX3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNX3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNX3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H3BNX3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BNX3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H3BNX3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BNX3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H3BNX3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H3BNX3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BNX3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H3BNX3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNX3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNX3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNX3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNX3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H3BNX3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNX3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNX3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNX3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H3BNX3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNX3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNX3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H3BNX3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNX3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNX3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H3BNX3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H3BNX3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
H3BNX3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BNX3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H3BNX3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H3BNX3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNX3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BNX3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BNX3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BNX3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BNX3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BNX3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BNX3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BNX3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BNX3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BNX3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BNX3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BNX3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNX3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNX3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNX3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNX3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BNX3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNX3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNX3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BNX3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BNX3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BNX3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BNX3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNX3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BNX3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNX3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNX3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNX3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BNX3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNX3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BNX3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNX3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNX3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNX3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BNX3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNX3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNX3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNX3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNX3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BNX3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNX3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BNX3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNX3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNX3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNX3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNX3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H3BNX3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNX3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H3BNX3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H3BNX3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNX3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNX3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNX3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNX3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNX3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNX3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNX3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H3BNX3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BNX3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BNX3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H3BNX3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H3BNX3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNX3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNX3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
H3BNX3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNX3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNX3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H3BNX3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms