Protein–RNA interactions for Protein: A6NM62

LRRC53, Leucine-rich repeat-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC53A6NM62 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC53A6NM62 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC53A6NM62 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC53A6NM62 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LRRC53A6NM62 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC53A6NM62 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC53A6NM62 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC53A6NM62 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC53A6NM62 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC53A6NM62 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC53A6NM62 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC53A6NM62 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC53A6NM62 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC53A6NM62 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC53A6NM62 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC53A6NM62 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms