Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
STRCP1A6NGW2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
STRCP1A6NGW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
STRCP1A6NGW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
STRCP1A6NGW2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
STRCP1A6NGW2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
STRCP1A6NGW2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
STRCP1A6NGW2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
STRCP1A6NGW2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
STRCP1A6NGW2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
STRCP1A6NGW2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.45■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms