Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
STRCP1A6NGW2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
STRCP1A6NGW2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
STRCP1A6NGW2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.91■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
STRCP1A6NGW2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
STRCP1A6NGW2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
STRCP1A6NGW2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
STRCP1A6NGW2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
STRCP1A6NGW2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
STRCP1A6NGW2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
STRCP1A6NGW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
STRCP1A6NGW2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
STRCP1A6NGW2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
STRCP1A6NGW2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
STRCP1A6NGW2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
STRCP1A6NGW2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
STRCP1A6NGW2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
STRCP1A6NGW2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
STRCP1A6NGW2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
STRCP1A6NGW2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.45■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
STRCP1A6NGW2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms