Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MEIS3P1A6NDR6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MEIS3P1A6NDR6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MEIS3P1A6NDR6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MEIS3P1A6NDR6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MEIS3P1A6NDR6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MEIS3P1A6NDR6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms