Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LCHNA4D1U4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LCHNA4D1U4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LCHNA4D1U4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCHNA4D1U4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCHNA4D1U4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LCHNA4D1U4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LCHNA4D1U4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LCHNA4D1U4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LCHNA4D1U4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LCHNA4D1U4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LCHNA4D1U4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LCHNA4D1U4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LCHNA4D1U4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LCHNA4D1U4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LCHNA4D1U4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LCHNA4D1U4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LCHNA4D1U4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LCHNA4D1U4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LCHNA4D1U4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LCHNA4D1U4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LCHNA4D1U4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LCHNA4D1U4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LCHNA4D1U4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms