Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTI8

TMEM272, Transmembrane protein 272, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM272A0A1B0GTI8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM272A0A1B0GTI8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM272A0A1B0GTI8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM272A0A1B0GTI8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM272A0A1B0GTI8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM272A0A1B0GTI8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms