Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1V0

IGHV3-15, Immunoglobulin heavy variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-15A0A0B4J1V0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGHV3-15A0A0B4J1V0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV3-15A0A0B4J1V0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGHV3-15A0A0B4J1V0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHV3-15A0A0B4J1V0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms