Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms