Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRBV6-7A0A0A0MS04 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TRBV6-7A0A0A0MS04 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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