Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A087WUJ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A087WUJ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A087WUJ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A087WUJ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A087WUJ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A087WUJ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms