Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 SHE2YKL130C 741 nt1.9□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 HHT2YNL031C 411 nt1.9□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 ARL3YPL051W 597 nt1.9□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 MET18YIL128W 3099 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 NAN1YPL126W 2691 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 ECM5YMR176W 4236 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YFR056CYFR056C 369 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 MPH1YIR002C 2982 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 HYR1YIR037W 492 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YJR023CYJR023C 402 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 GIM3YNL153C 390 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YCL020WYCL020W 1317 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 SCH9YHR205W 2475 nt1.89□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YLR302CYLR302C 363 nt1.88□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 LSM2YBL026W 288 nt1.88□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YCL023CYCL023C 348 nt1.88□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 UBP1YDL122W 2430 nt1.88□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 GIP3YPL137C 3831 nt1.88□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 GCN2YDR283C 4980 nt1.88□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 RRP6YOR001W 2202 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YDL009CYDL009C 324 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YDR537CYDR537C 606 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 RPL40AYIL148W 387 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 SRP21YKL122C 504 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YLR379WYLR379W 375 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 TAP42YMR028W 1101 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 OST2YOR103C 393 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 TRS20YBR254C 528 nt1.87□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 RRP12YPL012W 3687 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 MSL5YLR116W 1431 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YDL118WYDL118W 381 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YFL012WYFL012W 447 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YLR458WYLR458W 381 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YNL150WYNL150W 408 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YOR364WYOR364W 369 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 MUD1YBR119W 897 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 IST2YBR086C 2841 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 PEP1YBL017C 4740 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 SET2YJL168C 2202 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 REV1YOR346W 2958 nt1.86□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 SSF1YHR066W 1362 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 UBR2YLR024C 5619 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 UBP11YKR098C 2154 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 RTT107YHR154W 3213 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 RAM2YKL019W 951 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 LSM7YNL147W 348 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 RUD3YOR216C 1455 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 NDD1YOR372C 1665 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 GAL80YML051W 1308 nt1.85□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 NUP120YKL057C 3114 nt1.84□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 snR5snR5 204 nt1.84□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 RPL29YFR032C-A 180 nt1.84□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YGR226CYGR226C 210 nt1.84□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YIL058WYIL058W 285 nt1.84□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YKR051WYKR051W 1257 nt1.84□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt1.84□□□□□ -2.11
RRP42Q12277 MGA2YIR033W 3342 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 TUS1YLR425W 3924 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 FMP16YDR070C 282 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 NCB2YDR397C 441 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 RAD6YGL058W 519 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 LAG1YHL003C 1236 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YHR054CYHR054C 1065 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 PEP8YJL053W 1140 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 ECM9YKR004C 1134 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YCL007CYCL007C 393 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 CDC53YDL132W 2448 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 IPT1YDR072C 1584 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YJL016WYJL016W 1686 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 REV3YPL167C 4515 nt1.83□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 BUD2YKL092C 3315 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 TMA20YER007C-A 546 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 CSE4YKL049C 690 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 ATP18YML081C-A 180 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 URA5YML106W 681 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 PTC5YOR090C 1719 nt1.82□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 DIS3YOL021C 3006 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 LEU3YLR451W 2661 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 SNO3YFL060C 669 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 YPS5YGL259W 498 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 NOP10YHR072W-A 177 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 DFG10YIL049W 762 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 ATG38YLR211C 681 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 HRI1YLR301W 735 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 CCW14YLR390W-A 717 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 SNO2YNL334C 669 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 MGR1YCL044C 1254 nt1.81□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 VPS34YLR240W 2628 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 CAJ1YER048C 1176 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 IST3YIR005W 447 nt1.8□□□□□ -2.12
RRP42Q12277 MSL1YIR009W 336 nt1.8□□□□□ -2.12
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