Protein–RNA interactions for Protein: Q04214

TY1B-MR1, Transposon Ty1-MR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-MR1Q04214 SWI6YLR182W 2412 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 TAH1YCR060W 336 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 SPO74YGL170C 1242 nt0.84□□□□□ -2.27
TY1B-MR1Q04214 CTK1YKL139W 1587 nt0.84□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 FCF2YLR051C 654 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 NUP145YGL092W 3954 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 RPL31AYDL075W 342 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 MSS2YDL107W 1056 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 RSA3YLR221C 663 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 MFB1YDR219C 1398 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 UBP11YKR098C 2154 nt0.83□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 APC2YLR127C 2562 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 RTG3YBL103C 1461 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 ESC2YDR363W 1371 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 AVT5YBL089W 1380 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 RRP6YOR001W 2202 nt0.82□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 SEC1YDR164C 2175 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 CRD1YDL142C 852 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 ERV14YGL054C 417 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 YKL177WYKL177W 339 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 MED8YBR193C 672 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 PRK1YIL095W 2433 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 PUF4YGL014W 2667 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 snR76snR76 109 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 FMN1YDR236C 657 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 GLC7YER133W 939 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 CPR3YML078W 549 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 YRO2YBR054W 1035 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 YGR273CYGR273C 525 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 SNC1YAL030W 354 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 YLR379WYLR379W 375 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 ATG5YPL149W 885 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 YMR31YFR049W 372 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 RPS18BYML026C 441 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 DYN3YMR299C 939 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 BAG7YOR134W 1230 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 PEX27YOR193W 1131 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 FUS1YCL027W 1539 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 POL4YCR014C 1749 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 PRM4YPL156C 855 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 YPL238CYPL238C 390 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 YDR132CYDR132C 1488 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-MR1Q04214 RPL37BYDR500C 267 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 VOA1YGR106C 798 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 AEP3YPL005W 1821 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 BTT1YDR252W 450 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 CTK3YML112W 891 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 BST1YFL025C 3090 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 SHS1YDL225W 1656 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 NBL1YHR199C-A 222 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 CKA1YIL035C 1119 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 VTI1YMR197C 654 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 MSS4YDR208W 2340 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 EST2YLR318W 2655 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 RNH202YDR279W 1053 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 YLR400WYLR400W 474 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 PIN3YPR154W 648 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 PBP4YDL053C 558 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 UBC9YDL064W 474 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 RGI2YIL057C 495 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 YER107W-AYER107W-A 321 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 HHT2YNL031C 411 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 YNR066CYNR066C 1311 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 PUS9YDL036C 1389 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 ATP16YDL004W 483 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 ACB1YGR037C 264 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 MRPL25YGR076C 474 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 YGR190CYGR190C 366 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 SPC42YKL042W 1092 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 SRN2YLR119W 642 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 BEM3YPL115C 3387 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 HSE1YHL002W 1359 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 ESA1YOR244W 1338 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 MNE1YOR350C 1992 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 YOR203WYOR203W 354 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-MR1Q04214 CLG1YGL215W 1359 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 ALY2YJL084C 3141 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 PAF1YBR279W 1338 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 SHR3YDL212W 633 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 RMD5YDR255C 1266 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 YLR444CYLR444C 303 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 KAP122YGL016W 3246 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 HLR1YDR528W 1272 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 CTL1YMR180C 963 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 LRS4YDR439W 1044 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 YGR064WYGR064W 369 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 SRL1YOR247W 633 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 MPD1YOR288C 957 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 ACA1YER045C 1470 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 YLR149CYLR149C 2193 nt0.69□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 HMI1YOL095C 2121 nt0.69□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 CRM1YGR218W 3255 nt0.69□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 CDC50YCR094W 1176 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 UBC5YDR059C 447 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-MR1Q04214 MRP49YKL167C 414 nt0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.5 ms