RNA–Protein interactions for RNA: YER107W-A

YER107W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YER107W-A, Length 321 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER107W-AYER107W-A MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
YER107W-AYER107W-A FAP1P53971 965 aa12.93□□□□□ -0.34
YER107W-AYER107W-A PRY3P47033 881 aa12.17□□□□□ -0.46
YER107W-AYER107W-A AAD16Q02895 342 aa11.64□□□□□ -0.55
YER107W-AYER107W-A PRI1P10363 409 aa11.58□□□□□ -0.56
YER107W-AYER107W-A YCK3P39962 524 aa11.42□□□□□ -0.58
YER107W-AYER107W-A HAA1Q12753 694 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
YER107W-AYER107W-A DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
YER107W-AYER107W-A ISW2Q08773 1120 aa11.09□□□□□ -0.63
YER107W-AYER107W-A RPG1P38249 964 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
YER107W-AYER107W-A TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
YER107W-AYER107W-A MRPL32P25348 183 aa10.5□□□□□ -0.73
YER107W-AYER107W-A YGL015CP33199 130 aa10.32□□□□□ -0.76
YER107W-AYER107W-A DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
YER107W-AYER107W-A RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
YER107W-AYER107W-A REB1P21538 810 aa9.99□□□□□ -0.81
YER107W-AYER107W-A RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
YER107W-AYER107W-A RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
YER107W-AYER107W-A BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
YER107W-AYER107W-A CDC27P38042 758 aa9.79□□□□□ -0.84
YER107W-AYER107W-A UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
YER107W-AYER107W-A AVT3P36062 692 aa9.6□□□□□ -0.87
YER107W-AYER107W-A MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
YER107W-AYER107W-A YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
YER107W-AYER107W-A SPT21P35209 758 aa9.39□□□□□ -0.91
YER107W-AYER107W-A DCD1P06773 312 aa9.36□□□□□ -0.91
YER107W-AYER107W-A HOP09932 586 aa9.36□□□□□ -0.91
YER107W-AYER107W-A SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
YER107W-AYER107W-A TFC8Q12308 588 aa9.33□□□□□ -0.92
YER107W-AYER107W-A TIF4632P39936 914 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
YER107W-AYER107W-A SCY1P53009 804 aa9.25□□□□□ -0.93
YER107W-AYER107W-A UBP9P39967 754 aa9.24□□□□□ -0.93
YER107W-AYER107W-A TGL3P40308 642 aa9.22□□□□□ -0.93
YER107W-AYER107W-A SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
YER107W-AYER107W-A BCH2P36122 765 aa9□□□□□ -0.97
YER107W-AYER107W-A BFR2Q06631 534 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
YER107W-AYER107W-A RIM101P33400 625 aa8.87□□□□□ -0.99
YER107W-AYER107W-A YBL029C-AQ3E756 94 aa8.75□□□□□ -1.01
YER107W-AYER107W-A MST1P07236 462 aa8.7□□□□□ -1.02
YER107W-AYER107W-A BDF1P35817 686 aa8.7□□□□□ -1.02
YER107W-AYER107W-A EPS1P40557 701 aa8.7□□□□□ -1.02
YER107W-AYER107W-A YOR238WQ08634 303 aa8.65□□□□□ -1.02
YER107W-AYER107W-A VNX1P42839 908 aa8.6□□□□□ -1.03
YER107W-AYER107W-A OXP1P28273 1286 aa8.54□□□□□ -1.04
YER107W-AYER107W-A SPP1Q03012 353 aa8.54□□□□□ -1.04
YER107W-AYER107W-A NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.49□□□□□ -1.05not detected
YER107W-AYER107W-A PTP3P40048 928 aa8.49□□□□□ -1.05
YER107W-AYER107W-A WSC3Q12215 556 aa8.49□□□□□ -1.05
YER107W-AYER107W-A YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
YER107W-AYER107W-A YAP5P40574 245 aa8.45□□□□□ -1.06
YER107W-AYER107W-A YJL171CP46992 396 aa8.44□□□□□ -1.06
YER107W-AYER107W-A AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
YER107W-AYER107W-A BBC1P47068 1157 aa8.39□□□□□ -1.07
YER107W-AYER107W-A TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
YER107W-AYER107W-A FKH1P40466 484 aa8.37□□□□□ -1.07
YER107W-AYER107W-A AI2P03876 854 aa8.32□□□□□ -1.08
YER107W-AYER107W-A GTT3P39996 337 aa8.32□□□□□ -1.08
YER107W-AYER107W-A RSM7P47150 247 aa8.31□□□□□ -1.08
YER107W-AYER107W-A LDB19Q12502 818 aa8.26□□□□□ -1.09
YER107W-AYER107W-A BMT6Q12291 365 aa8.23□□□□□ -1.09
YER107W-AYER107W-A ULI1P43604 169 aa8.22□□□□□ -1.09
YER107W-AYER107W-A YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
YER107W-AYER107W-A IOC2Q12072 812 aa8.19□□□□□ -1.1
YER107W-AYER107W-A PIB1Q06651 286 aa8.16□□□□□ -1.1
YER107W-AYER107W-A MSB4Q12317 492 aa8.04□□□□□ -1.12
YER107W-AYER107W-A RTG1P32607 177 aa8.03□□□□□ -1.12
YER107W-AYER107W-A EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
YER107W-AYER107W-A NCR1Q12200 1170 aa8.01□□□□□ -1.13
YER107W-AYER107W-A YLR271WQ06152 274 aa7.99□□□□□ -1.13
YER107W-AYER107W-A TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
YER107W-AYER107W-A SET4P42948 560 aa7.98□□□□□ -1.13
YER107W-AYER107W-A MRM1P25270 412 aa7.97□□□□□ -1.13
YER107W-AYER107W-A PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
YER107W-AYER107W-A YOL036WQ08206 761 aa7.96□□□□□ -1.14
YER107W-AYER107W-A YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
YER107W-AYER107W-A SEC61P32915 480 aa7.9□□□□□ -1.14
YER107W-AYER107W-A DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
YER107W-AYER107W-A TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
YER107W-AYER107W-A YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.84□□□□□ -1.15not detected
YER107W-AYER107W-A YFR006WP43590 535 aa7.82□□□□□ -1.16
YER107W-AYER107W-A VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
YER107W-AYER107W-A BCK2P33306 851 aa7.8□□□□□ -1.16
YER107W-AYER107W-A SAP30P38429 201 aa7.8□□□□□ -1.16
YER107W-AYER107W-A VPS29P38759 282 aa7.79□□□□□ -1.16
YER107W-AYER107W-A SAM3Q08986 587 aa7.77□□□□□ -1.17
YER107W-AYER107W-A STS1P38637 319 aa7.74□□□□□ -1.17
YER107W-AYER107W-A CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
YER107W-AYER107W-A RTG3P38165 486 aa7.73□□□□□ -1.17
YER107W-AYER107W-A DAN4P47179 1161 aa7.73□□□□□ -1.17
YER107W-AYER107W-A JIP4Q03361 876 aa7.71□□□□□ -1.18
YER107W-AYER107W-A YDL129WQ07555 291 aa7.71□□□□□ -1.18
YER107W-AYER107W-A ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.7□□□□□ -1.18not detected
YER107W-AYER107W-A PRE3P38624 215 aa7.68□□□□□ -1.18
YER107W-AYER107W-A CST9Q06032 482 aa7.67□□□□□ -1.18
YER107W-AYER107W-A SSP1P38871 571 aa7.64□□□□□ -1.19
YER107W-AYER107W-A GYP5Q12344 894 aa7.64□□□□□ -1.19
YER107W-AYER107W-A ABP1P15891 592 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
YER107W-AYER107W-A HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
YER107W-AYER107W-A HTA2P04912 132 aa7.62□□□□□ -1.19
YER107W-AYER107W-A TFA1P36100 482 aa7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 78.8 ms