Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YAL066WYAL066W 309 nt1.77□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YNL179CYNL179C 438 nt1.77□□□□□ -2.13
DDI1P40087 TOA1YOR194C 861 nt1.77□□□□□ -2.13
DDI1P40087 URK1YNR012W 1506 nt1.76□□□□□ -2.13
DDI1P40087 MNE1YOR350C 1992 nt1.76□□□□□ -2.13
DDI1P40087 CDC53YDL132W 2448 nt1.76□□□□□ -2.13
DDI1P40087 AHC2YCR082W 387 nt1.76□□□□□ -2.13
DDI1P40087 CDC50YCR094W 1176 nt1.76□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YJR023CYJR023C 402 nt1.76□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YML084WYML084W 309 nt1.76□□□□□ -2.13
DDI1P40087 CDC60YPL160W 3273 nt1.76□□□□□ -2.13
DDI1P40087 VPS34YLR240W 2628 nt1.76□□□□□ -2.13
DDI1P40087 BUD2YKL092C 3315 nt1.76□□□□□ -2.13
DDI1P40087 UTP21YLR409C 2820 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YDR248CYDR248C 582 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 VPS74YDR372C 1038 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 RSM18YER050C 417 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YPS5YGL259W 498 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 SRP21YKL122C 504 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 RLP24YLR009W 600 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YLR053CYLR053C 327 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 ICY1YMR195W 384 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 HHT2YNL031C 411 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 OST2YOR103C 393 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 TRS20YBR254C 528 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 NAN1YPL126W 2691 nt1.75□□□□□ -2.13
DDI1P40087 CAT2YML042W 2013 nt1.74□□□□□ -2.13
DDI1P40087 NDD1YOR372C 1665 nt1.74□□□□□ -2.13
DDI1P40087 MGA2YIR033W 3342 nt1.74□□□□□ -2.13
DDI1P40087 COX13YGL191W 390 nt1.74□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YJL147CYJL147C 1149 nt1.74□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YPT6YLR262C 648 nt1.74□□□□□ -2.13
DDI1P40087 PDP3YLR455W 915 nt1.74□□□□□ -2.13
DDI1P40087 LSM7YNL147W 348 nt1.74□□□□□ -2.13
DDI1P40087 NCL1YBL024W 2055 nt1.74□□□□□ -2.13
DDI1P40087 PEP1YBL017C 4740 nt1.74□□□□□ -2.13
DDI1P40087 DFG16YOR030W 1860 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 PBP4YDL053C 558 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YDR115WYDR115W 318 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 RPL37BYDR500C 267 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 IRC4YDR540C 540 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 HOP2YGL033W 657 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YGL042CYGL042C 306 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 FSH1YHR049W 732 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 NOP10YHR072W-A 177 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 MSL1YIR009W 336 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 TMA7YLR262C-A 195 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YLR302CYLR302C 363 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 URA5YML106W 681 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 DCP1YOL149W 696 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 HER1YOR227W 3741 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 VPS15YBR097W 4365 nt1.73□□□□□ -2.13
DDI1P40087 CFT2YLR115W 2580 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 BFA1YJR053W 1725 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 RNH70YGR276C 1662 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 snR59snR59 78 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 BRP1YGL007W 378 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YIP1YGR172C 747 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YIL082WYIL082W 873 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YLR458WYLR458W 381 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 LSM2YBL026W 288 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 SIP18YMR175W 240 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 YDR341CYDR341C 1824 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 IRC10YOL015W 1761 nt1.72□□□□□ -2.13
DDI1P40087 GYP5YPL249C 2685 nt1.71□□□□□ -2.14
DDI1P40087 SSQ1YLR369W 1974 nt1.71□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.71□□□□□ -2.14
DDI1P40087 RAD6YGL058W 519 nt1.71□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YGR115CYGR115C 780 nt1.71□□□□□ -2.14
DDI1P40087 RPL40AYIL148W 387 nt1.71□□□□□ -2.14
DDI1P40087 ERG29YMR134W 714 nt1.71□□□□□ -2.14
DDI1P40087 RPB5YBR154C 648 nt1.71□□□□□ -2.14
DDI1P40087 MGR1YCL044C 1254 nt1.71□□□□□ -2.14
DDI1P40087 SYH1YPL105C 2550 nt1.7□□□□□ -2.14
DDI1P40087 SHE4YOR035C 2370 nt1.7□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YDR018CYDR018C 1191 nt1.7□□□□□ -2.14
DDI1P40087 TDA2YER071C 381 nt1.7□□□□□ -2.14
DDI1P40087 TAD1YGL243W 1203 nt1.7□□□□□ -2.14
DDI1P40087 IST3YIR005W 447 nt1.7□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt1.7□□□□□ -2.14
DDI1P40087 TAP42YMR028W 1101 nt1.7□□□□□ -2.14
DDI1P40087 POP7YBR167C 423 nt1.7□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.7□□□□□ -2.14
DDI1P40087 IRA1YBR140C 9279 nt1.69□□□□□ -2.14
DDI1P40087 CAJ1YER048C 1176 nt1.69□□□□□ -2.14
DDI1P40087 ATP7YKL016C 525 nt1.69□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.69□□□□□ -2.14
DDI1P40087 HCS1YKL017C 2052 nt1.68□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.68□□□□□ -2.14
DDI1P40087 YNL235CYNL235C 432 nt1.68□□□□□ -2.14
DDI1P40087 IPP1YBR011C 864 nt1.68□□□□□ -2.14
DDI1P40087 SPC72YAL047C 1869 nt1.68□□□□□ -2.14
DDI1P40087 SAC3YDR159W 3906 nt1.68□□□□□ -2.14
DDI1P40087 MYO4YAL029C 4416 nt1.68□□□□□ -2.14
DDI1P40087 IRC2YDR112W 309 nt1.67□□□□□ -2.14
DDI1P40087 RPL29YFR032C-A 180 nt1.67□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.8 ms