Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 NSR1YGR159C 1245 nt18.33■□□□□ 0.52
DDI1P40087 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.95■□□□□ 0.46
DDI1P40087 NOP1YDL014W 984 nt17.26■□□□□ 0.35
DDI1P40087 MDJ1YFL016C 1536 nt16.78■□□□□ 0.28
DDI1P40087 YJL027CYJL027C 417 nt15.49■□□□□ 0.07
DDI1P40087 YKL036CYKL036C 393 nt15.35■□□□□ 0.05
DDI1P40087 SRX1YKL086W 384 nt15.02■□□□□ -0
DDI1P40087 Q0297Q0297 156 nt14.85□□□□□ -0.03
DDI1P40087 DBP2YNL112W 1641 nt14.56□□□□□ -0.08
DDI1P40087 YBR190WYBR190W 312 nt14.49□□□□□ -0.09
DDI1P40087 SSA3YBL075C 1950 nt14.45□□□□□ -0.1
DDI1P40087 YCR051WYCR051W 669 nt14.25□□□□□ -0.13
DDI1P40087 RTC3YHR087W 336 nt14.19□□□□□ -0.14
DDI1P40087 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.89□□□□□ -0.19
DDI1P40087 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.89□□□□□ -0.19
DDI1P40087 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.89□□□□□ -0.19
DDI1P40087 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.89□□□□□ -0.19
DDI1P40087 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.89□□□□□ -0.19
DDI1P40087 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.89□□□□□ -0.19
DDI1P40087 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.89□□□□□ -0.19
DDI1P40087 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.89□□□□□ -0.19
DDI1P40087 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.89□□□□□ -0.19
DDI1P40087 CCC1YLR220W 969 nt13.81□□□□□ -0.2
DDI1P40087 RVS167YDR388W 1449 nt13.71□□□□□ -0.22
DDI1P40087 SCS3YGL126W 1143 nt13.63□□□□□ -0.23
DDI1P40087 PUT4YOR348C 1884 nt13.54□□□□□ -0.24
DDI1P40087 SCJ1YMR214W 1134 nt13.38□□□□□ -0.27
DDI1P40087 RPP1BYDL130W 321 nt13.34□□□□□ -0.27
DDI1P40087 YOL085CYOL085C 342 nt13.28□□□□□ -0.28
DDI1P40087 PKP1YIL042C 1185 nt13.16□□□□□ -0.3
DDI1P40087 ARE1YCR048W 1833 nt13.12□□□□□ -0.31
DDI1P40087 POA1YBR022W 534 nt13.11□□□□□ -0.31
DDI1P40087 SHR5YOL110W 714 nt13.03□□□□□ -0.32
DDI1P40087 URN1YPR152C 1398 nt13.03□□□□□ -0.32
DDI1P40087 SAH1YER043C 1350 nt13□□□□□ -0.33
DDI1P40087 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.99□□□□□ -0.33
DDI1P40087 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.97□□□□□ -0.33
DDI1P40087 OPI9YLR338W 858 nt12.94□□□□□ -0.34
DDI1P40087 BSC6YOL137W 1494 nt12.92□□□□□ -0.34
DDI1P40087 DEP1YAL013W 1218 nt12.86□□□□□ -0.35
DDI1P40087 PET122YER153C 765 nt12.79□□□□□ -0.36
DDI1P40087 RPN10YHR200W 807 nt12.76□□□□□ -0.37
DDI1P40087 BUD23YCR047C 828 nt12.69□□□□□ -0.38
DDI1P40087 SPT5YML010W 3192 nt12.64□□□□□ -0.39
DDI1P40087 YNL208WYNL208W 600 nt12.61□□□□□ -0.39
DDI1P40087 PUN1YLR414C 792 nt12.59□□□□□ -0.39
DDI1P40087 SCR1SCR1 522 nt12.58□□□□□ -0.4
DDI1P40087 YDJ1YNL064C 1230 nt12.56□□□□□ -0.4
DDI1P40087 SSA4YER103W 1929 nt12.54□□□□□ -0.4
DDI1P40087 PTC2YER089C 1395 nt12.52□□□□□ -0.41
DDI1P40087 NAB2YGL122C 1578 nt12.44□□□□□ -0.42
DDI1P40087 GAR1YHR089C 618 nt12.39□□□□□ -0.43
DDI1P40087 YJR018WYJR018W 363 nt12.39□□□□□ -0.43
DDI1P40087 RRN5YLR141W 1092 nt12.37□□□□□ -0.43
DDI1P40087 MEP2YNL142W 1500 nt12.19□□□□□ -0.46
DDI1P40087 PAC11YDR488C 1602 nt12.18□□□□□ -0.46
DDI1P40087 FPR4YLR449W 1179 nt12.17□□□□□ -0.46
DDI1P40087 DAL1YIR027C 1383 nt12.17□□□□□ -0.46
DDI1P40087 FIS1YIL065C 468 nt12.14□□□□□ -0.47
DDI1P40087 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.12□□□□□ -0.47
DDI1P40087 BDF1YLR399C 2061 nt12.07□□□□□ -0.48
DDI1P40087 INM2YDR287W 879 nt12.05□□□□□ -0.48
DDI1P40087 RPP2BYDR382W 333 nt12.05□□□□□ -0.48
DDI1P40087 ATS1YAL020C 1002 nt12.04□□□□□ -0.48
DDI1P40087 PHO4YFR034C 939 nt12.03□□□□□ -0.48
DDI1P40087 NVJ2YPR091C 2313 nt12.02□□□□□ -0.49
DDI1P40087 TIR1YER011W 765 nt11.99□□□□□ -0.49
DDI1P40087 RSB1YOR049C 1065 nt11.99□□□□□ -0.49
DDI1P40087 YPS1YLR120C 1710 nt11.99□□□□□ -0.49
DDI1P40087 YJR120WYJR120W 351 nt11.97□□□□□ -0.49
DDI1P40087 DCW1YKL046C 1350 nt11.96□□□□□ -0.49
DDI1P40087 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.95□□□□□ -0.5
DDI1P40087 SSA1YAL005C 1929 nt11.92□□□□□ -0.5
DDI1P40087 TAT1YBR069C 1860 nt11.91□□□□□ -0.5
DDI1P40087 YMR090WYMR090W 684 nt11.87□□□□□ -0.51
DDI1P40087 EMI2YDR516C 1503 nt11.82□□□□□ -0.52
DDI1P40087 YDR095CYDR095C 411 nt11.82□□□□□ -0.52
DDI1P40087 YBL100CYBL100C 315 nt11.82□□□□□ -0.52
DDI1P40087 YBR220CYBR220C 1683 nt11.76□□□□□ -0.53
DDI1P40087 YDL221WYDL221W 552 nt11.68□□□□□ -0.54
DDI1P40087 ALF1YNL148C 765 nt11.66□□□□□ -0.54
DDI1P40087 FUN26YAL022C 1554 nt11.66□□□□□ -0.54
DDI1P40087 BDH2YAL061W 1254 nt11.65□□□□□ -0.54
DDI1P40087 SDH1YKL148C 1923 nt11.64□□□□□ -0.55
DDI1P40087 RPP2AYOL039W 321 nt11.63□□□□□ -0.55
DDI1P40087 FPS1YLL043W 2010 nt11.62□□□□□ -0.55
DDI1P40087 CAC2YML102W 1407 nt11.6□□□□□ -0.55
DDI1P40087 PTP1YDL230W 1008 nt11.57□□□□□ -0.56
DDI1P40087 TRM9YML014W 840 nt11.57□□□□□ -0.56
DDI1P40087 SRB2YHR041C 633 nt11.55□□□□□ -0.56
DDI1P40087 SCC4YER147C 1875 nt11.5□□□□□ -0.57
DDI1P40087 SEC11YIR022W 504 nt11.48□□□□□ -0.57
DDI1P40087 PCH2YBR186W 1695 nt11.46□□□□□ -0.57
DDI1P40087 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.44□□□□□ -0.58
DDI1P40087 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.44□□□□□ -0.58
DDI1P40087 CCT6YDR188W 1641 nt11.43□□□□□ -0.58
DDI1P40087 IRC15YPL017C 1500 nt11.42□□□□□ -0.58
DDI1P40087 SIS1YNL007C 1059 nt11.42□□□□□ -0.58
DDI1P40087 GUT2YIL155C 1950 nt11.41□□□□□ -0.58
DDI1P40087 LSM3YLR438C-A 270 nt11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.5 ms