Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
J3QLW9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QLW9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QLW9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QLW9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QLW9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms