Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPRYD3Q8NCJ5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms