RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619142.4

GTF2IRD2B-208, Transcript of GTF2I repeat domain containing 2B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2IRD2B, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.55	■■■■■ 4.88
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.64	■■■■□ 3.94
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.3	■■■■□ 3.72
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.67	■■■■□ 3.62
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.55	■■■■□ 3.6
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	ABCC9	O60706	1549 aa		37.28	■■■■□ 3.56
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		37.27	■■■■□ 3.56
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.16	■■■■□ 3.54
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	NACAD	O15069	1562 aa		36.87	■■■■□ 3.49
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		36.5	■■■■□ 3.43
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.47	■■■■□ 3.43
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	35.97	■■■■□ 3.35
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.8	■■■■□ 3.32
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	35.41	■■■■□ 3.26
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35.4	■■■■□ 3.26
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.37	■■■■□ 3.25
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.2	■■■■□ 3.23
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.19	■■■■□ 3.22
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.16	■■■■□ 3.22
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.98	■■■■□ 3.19
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	WIZ	O95785	1651 aa		34.92	■■■■□ 3.18
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.57	■■■■□ 3.12
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		34.55	■■■■□ 3.12
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.55	■■■■□ 3.12
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.35	■■■■□ 3.09
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.35	■■■■□ 3.09
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.32	■■■■□ 3.08
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.22	■■■■□ 3.07
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.17	■■■■□ 3.06
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.03	■■■■□ 3.04
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34	■■■■□ 3.03
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.82	■■■■□ 3
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.76	■■■■□ 3
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.55	■■■□□ 2.96
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	33.33	■■■□□ 2.93
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CFTR	P13569	1480 aa		33.33	■■■□□ 2.93
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.22	■■■□□ 2.91
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.19	■■■□□ 2.9
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	SYNJ1	O43426	1573 aa		33.18	■■■□□ 2.9
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.17	■■■□□ 2.9
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	TOP2B	Q02880	1626 aa		33.04	■■■□□ 2.88
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		33	■■■□□ 2.87
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33	■■■□□ 2.87
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	SOGA1	O94964	1423 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	EEA1	Q15075	1411 aa		32.96	■■■□□ 2.87
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CUX1	P39880	1505 aa		32.89	■■■□□ 2.86
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.84	■■■□□ 2.85
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.83	■■■□□ 2.85
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	NES	P48681	1621 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.8	■■■□□ 2.84
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.76	■■■□□ 2.83
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.7	■■■□□ 2.83
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.58	■■■□□ 2.81
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.55	■■■□□ 2.8
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	KIF21B	O75037	1637 aa		32.52	■■■□□ 2.8
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	GOLGA3	Q08378	1498 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.51	■■■□□ 2.79
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.47	■■■□□ 2.79
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		32.45	■■■□□ 2.79
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.43	■■■□□ 2.78
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CUX2	O14529	1486 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	PRX	Q9BXM0	1461 aa		32.3	■■■□□ 2.76
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	IGF1R	P08069	1367 aa		32.16	■■■□□ 2.74
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.15	■■■□□ 2.74
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.11	■■■□□ 2.73
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		32.01	■■■□□ 2.71
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CLIP1	P30622	1438 aa		32	■■■□□ 2.71
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	WDR62	O43379	1518 aa		31.97	■■■□□ 2.71
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.96	■■■□□ 2.71
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CUL7	Q14999	1698 aa		31.91	■■■□□ 2.7
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		31.9	■■■□□ 2.7
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.88	■■■□□ 2.69
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.79	■■■□□ 2.68
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.74	■■■□□ 2.67
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.69	■■■□□ 2.66
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.66	■■■□□ 2.66
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.65	■■■□□ 2.66
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.62	■■■□□ 2.65
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.6	■■■□□ 2.65
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		31.59	■■■□□ 2.65
GTF2IRD2B-208	ENST00000619142	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.54	■■■□□ 2.64

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