Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SS18Q15532 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SS18Q15532 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SS18Q15532 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SS18Q15532 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SS18Q15532 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SS18Q15532 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
SS18Q15532 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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