Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KPNA2P52292 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KPNA2P52292 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms