Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BHLHA9Q7RTU4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHLHA9Q7RTU4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms