RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243893.10

UBE2C-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 476 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-201ENST00000243893 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.25■■■■■ 5.31
UBE2C-201ENST00000243893 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.57■■■■■ 4.41
UBE2C-201ENST00000243893 ABCC9O60706 1549 aa40.83■■■■■ 4.13
UBE2C-201ENST00000243893 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
UBE2C-201ENST00000243893 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.04■■■■■ 4
UBE2C-201ENST00000243893 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.95■■■■□ 3.99
UBE2C-201ENST00000243893 NACADO15069 1562 aa39.86■■■■□ 3.97
UBE2C-201ENST00000243893 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.86■■■■□ 3.97
UBE2C-201ENST00000243893 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.68■■■■□ 3.94
UBE2C-201ENST00000243893 SCRIBQ14160 1630 aa38.81■■■■□ 3.8
UBE2C-201ENST00000243893 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.71■■■■□ 3.79
UBE2C-201ENST00000243893 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.45■■■■□ 3.75
UBE2C-201ENST00000243893 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.44■■■■□ 3.74
UBE2C-201ENST00000243893 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.25■■■■□ 3.71
UBE2C-201ENST00000243893 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.45■■■■□ 3.59
UBE2C-201ENST00000243893 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
UBE2C-201ENST00000243893 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
UBE2C-201ENST00000243893 SMARCA4P51532 1647 aa37.25■■■■□ 3.55
UBE2C-201ENST00000243893 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.17■■■■□ 3.54
UBE2C-201ENST00000243893 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
UBE2C-201ENST00000243893 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.99■■■■□ 3.51
UBE2C-201ENST00000243893 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.95■■■■□ 3.51
UBE2C-201ENST00000243893 SMARCA2P51531 1590 aa36.9■■■■□ 3.5
UBE2C-201ENST00000243893 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.88■■■■□ 3.5
UBE2C-201ENST00000243893 NCAPD3P42695 1498 aa36.78■■■■□ 3.48
UBE2C-201ENST00000243893 WIZO95785 1651 aa36.76■■■■□ 3.47
UBE2C-201ENST00000243893 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.75■■■■□ 3.47
UBE2C-201ENST00000243893 HMGXB3Q12766 1538 aa36.67■■■■□ 3.46
UBE2C-201ENST00000243893 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
UBE2C-201ENST00000243893 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
UBE2C-201ENST00000243893 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
UBE2C-201ENST00000243893 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.04■■■■□ 3.36
UBE2C-201ENST00000243893 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.72■■■■□ 3.31
UBE2C-201ENST00000243893 CFTRP13569 1480 aa35.68■■■■□ 3.3
UBE2C-201ENST00000243893 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.66■■■■□ 3.3
UBE2C-201ENST00000243893 NESP48681 1621 aa35.55■■■■□ 3.28
UBE2C-201ENST00000243893 PRDM2Q13029 1718 aa35.43■■■■□ 3.26
UBE2C-201ENST00000243893 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.4■■■■□ 3.26
UBE2C-201ENST00000243893 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.29■■■■□ 3.24
UBE2C-201ENST00000243893 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.18■■■■□ 3.22
UBE2C-201ENST00000243893 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.15■■■■□ 3.22
UBE2C-201ENST00000243893 ERCC6Q03468 1493 aa35.15■■■■□ 3.22
UBE2C-201ENST00000243893 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.98■■■■□ 3.19
UBE2C-201ENST00000243893 ABCC8Q09428 1581 aa34.91■■■■□ 3.18
UBE2C-201ENST00000243893 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.91■■■■□ 3.18
UBE2C-201ENST00000243893 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
UBE2C-201ENST00000243893 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
UBE2C-201ENST00000243893 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.85■■■■□ 3.17
UBE2C-201ENST00000243893 WDR62O43379 1518 aa34.84■■■■□ 3.17
UBE2C-201ENST00000243893 CUX1P39880 1505 aa34.83■■■■□ 3.17
UBE2C-201ENST00000243893 TOPBP1Q92547 1522 aa34.82■■■■□ 3.16
UBE2C-201ENST00000243893 TOP2BQ02880 1626 aa34.75■■■■□ 3.15
UBE2C-201ENST00000243893 SYNJ1O43426 1573 aa34.74■■■■□ 3.15
UBE2C-201ENST00000243893 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.74■■■■□ 3.15
UBE2C-201ENST00000243893 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.67■■■■□ 3.14
UBE2C-201ENST00000243893 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.59■■■■□ 3.13
UBE2C-201ENST00000243893 TRIM41Q8WV44 630 aa34.58■■■■□ 3.13
UBE2C-201ENST00000243893 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
UBE2C-201ENST00000243893 CUX2O14529 1486 aa34.57■■■■□ 3.12
UBE2C-201ENST00000243893 IFT140Q96RY7 1462 aa34.44■■■■□ 3.1
UBE2C-201ENST00000243893 SOGA1O94964 1423 aa34.43■■■■□ 3.1
UBE2C-201ENST00000243893 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
UBE2C-201ENST00000243893 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.37■■■■□ 3.09
UBE2C-201ENST00000243893 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.34■■■■□ 3.09
UBE2C-201ENST00000243893 WDR97A6NE52 1622 aa34.26■■■■□ 3.08
UBE2C-201ENST00000243893 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
UBE2C-201ENST00000243893 KIF27Q86VH2 1401 aa34.14■■■■□ 3.06
UBE2C-201ENST00000243893 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
UBE2C-201ENST00000243893 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.11■■■■□ 3.05
UBE2C-201ENST00000243893 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
UBE2C-201ENST00000243893 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.06■■■■□ 3.04
UBE2C-201ENST00000243893 EEA1Q15075 1411 aa34.05■■■■□ 3.04
UBE2C-201ENST00000243893 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.05■■■■□ 3.046e-10■■■■■ 45.2
UBE2C-201ENST00000243893 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.98■■■■□ 3.03
UBE2C-201ENST00000243893 GRIN2BQ13224 1484 aa33.97■■■■□ 3.03
UBE2C-201ENST00000243893 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.94■■■■□ 3.02
UBE2C-201ENST00000243893 IGF1RP08069 1367 aa33.89■■■■□ 3.02
UBE2C-201ENST00000243893 PBRM1Q86U86 1689 aa33.89■■■■□ 3.02
UBE2C-201ENST00000243893 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.82■■■■□ 3
UBE2C-201ENST00000243893 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
UBE2C-201ENST00000243893 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.77■■■■□ 3
UBE2C-201ENST00000243893 CUL7Q14999 1698 aa33.77■■■■□ 3
UBE2C-201ENST00000243893 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
UBE2C-201ENST00000243893 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.72■■■□□ 2.99
UBE2C-201ENST00000243893 ADAMTS12P58397 1594 aa33.72■■■□□ 2.99
UBE2C-201ENST00000243893 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.7■■■□□ 2.98
UBE2C-201ENST00000243893 PRXQ9BXM0 1461 aa33.69■■■□□ 2.98
UBE2C-201ENST00000243893 SYNJ2O15056 1496 aa33.66■■■□□ 2.98
UBE2C-201ENST00000243893 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.6■■■□□ 2.97
UBE2C-201ENST00000243893 KIF21BO75037 1637 aa33.59■■■□□ 2.97
UBE2C-201ENST00000243893 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
UBE2C-201ENST00000243893 GRIN2AQ12879 1464 aa33.53■■■□□ 2.96
UBE2C-201ENST00000243893 FBLN2P98095 1184 aa33.45■■■□□ 2.95
UBE2C-201ENST00000243893 CHD1O14646 1710 aa33.45■■■□□ 2.94
UBE2C-201ENST00000243893 GOLGA3Q08378 1498 aa33.44■■■□□ 2.94
UBE2C-201ENST00000243893 NUP160Q12769 1436 aa33.37■■■□□ 2.93
UBE2C-201ENST00000243893 CEP170Q5SW79 1584 aa33.29■■■□□ 2.92
UBE2C-201ENST00000243893 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.24■■■□□ 2.91
UBE2C-201ENST00000243893 OSCARQ8IYS5 282 aa33.24■■■□□ 2.91
UBE2C-201ENST00000243893 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
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