Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QLW9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QLW9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QLW9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QLW9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QLW9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
J3QLW9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QLW9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QLW9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QLW9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QLW9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QLW9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QLW9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QLW9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
J3QLW9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
J3QLW9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
J3QLW9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
J3QLW9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QLW9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QLW9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QLW9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
J3QLW9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
J3QLW9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms