Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VPREB3Q9UKI3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VPREB3Q9UKI3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms