Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
TNIKQ9UKE5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC33.78■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC33.78■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TNIKQ9UKE5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNIKQ9UKE5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms