RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409749.7

ASB18-201, Transcript of ankyrin repeat and SOCS box containing 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ASB18, Length 1,401 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASB18-201ENST00000409749 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.19■■■■■ 5.47
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ASB18-201ENST00000409749 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.58■■■■■ 4.25
ASB18-201ENST00000409749 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.52■■■■■ 4.24
ASB18-201ENST00000409749 NACADO15069 1562 aa41.41■■■■■ 4.22
ASB18-201ENST00000409749 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.96■■■■■ 4.15
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ASB18-201ENST00000409749 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.34■■■■■ 4.05
ASB18-201ENST00000409749 SCRIBQ14160 1630 aa40.08■■■■■ 4.01
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ASB18-201ENST00000409749 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.3■■■■□ 3.88
ASB18-201ENST00000409749 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.16■■■■□ 3.86
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ASB18-201ENST00000409749 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.21■■■■□ 3.71
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ASB18-201ENST00000409749 SMARCA2P51531 1590 aa38.1■■■■□ 3.69
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ASB18-201ENST00000409749 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.85■■■■□ 3.65
ASB18-201ENST00000409749 ERCC6Q03468 1493 aa37.56■■■■□ 3.6
ASB18-201ENST00000409749 NESP48681 1621 aa37.52■■■■□ 3.6
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ASB18-201ENST00000409749 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.28■■■■□ 3.56
ASB18-201ENST00000409749 CUX2O14529 1486 aa37.28■■■■□ 3.56
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ASB18-201ENST00000409749 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.71■■■■□ 3.47
ASB18-201ENST00000409749 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.69■■■■□ 3.46
ASB18-201ENST00000409749 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.66■■■■□ 3.46
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ASB18-201ENST00000409749 PRDM2Q13029 1718 aa36.33■■■■□ 3.41
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ASB18-201ENST00000409749 TOPBP1Q92547 1522 aa36.05■■■■□ 3.36
ASB18-201ENST00000409749 ABCC8Q09428 1581 aa36■■■■□ 3.35
ASB18-201ENST00000409749 IFT140Q96RY7 1462 aa35.95■■■■□ 3.35
ASB18-201ENST00000409749 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.93■■■■□ 3.34
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ASB18-201ENST00000409749 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.62■■■■□ 3.29
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ASB18-201ENST00000409749 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
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ASB18-201ENST00000409749 FBLN2P98095 1184 aa35.37■■■■□ 3.25
ASB18-201ENST00000409749 WDR97A6NE52 1622 aa35.29■■■■□ 3.24
ASB18-201ENST00000409749 CHD1O14646 1710 aa35.25■■■■□ 3.23
ASB18-201ENST00000409749 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.24■■■■□ 3.23
ASB18-201ENST00000409749 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.22■■■■□ 3.23
ASB18-201ENST00000409749 GRIN2BQ13224 1484 aa35.21■■■■□ 3.23
ASB18-201ENST00000409749 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.17■■■■□ 3.22
ASB18-201ENST00000409749 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
ASB18-201ENST00000409749 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.16■■■■□ 3.22
ASB18-201ENST00000409749 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
ASB18-201ENST00000409749 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.13■■■■□ 3.21
ASB18-201ENST00000409749 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.13■■■■□ 3.21
ASB18-201ENST00000409749 TOP2BQ02880 1626 aa35.13■■■■□ 3.21
ASB18-201ENST00000409749 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.13■■■■□ 3.21
ASB18-201ENST00000409749 SYNJ1O43426 1573 aa35.11■■■■□ 3.21
ASB18-201ENST00000409749 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.1■■■■□ 3.21
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ASB18-201ENST00000409749 SYNJ2O15056 1496 aa35.03■■■■□ 3.2
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ASB18-201ENST00000409749 KIF27Q86VH2 1401 aa34.53■■■■□ 3.12
ASB18-201ENST00000409749 IGF1RP08069 1367 aa34.47■■■■□ 3.11
ASB18-201ENST00000409749 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.41■■■■□ 3.1
ASB18-201ENST00000409749 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
ASB18-201ENST00000409749 JPH4Q96JJ6 628 aa34.35■■■■□ 3.09
ASB18-201ENST00000409749 SHROOM2Q13796 1616 aa34.34■■■■□ 3.09
ASB18-201ENST00000409749 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
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