Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMAD1Q15797 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMAD1Q15797 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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