Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLF12Q9Y4X4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms