Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CGGBP1Q9UFW8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGGBP1Q9UFW8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms