Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	YGR283C	YGR283C	1026 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YJL032W	YJL032W	315 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YMR158C-A	YMR158C-A	138 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YNL089C	YNL089C	477 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	KTI11	YBL071W-A	249 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	RRG8	YPR116W	834 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	RFC5	YBR087W	1065 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	SWC4	YGR002C	1431 nt		2.33	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	VHR1	YIL056W	1923 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YDR209C	YDR209C	414 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	RPN9	YDR427W	1182 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	CAJ1	YER048C	1176 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	MAM1	YER106W	909 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	RPL22B	YFL034C-A	369 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YGL242C	YGL242C	546 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	LIP2	YLR239C	987 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	FAR3	YMR052W	615 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	TYE7	YOR344C	876 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	SPT14	YPL175W	1359 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YEF3	YLR249W	3135 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	MAK11	YKL021C	1407 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	ADY4	YLR227C	1482 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	SKT5	YBL061C	2091 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	UTP14	YML093W	2700 nt		2.32	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	UBP15	YMR304W	3693 nt		2.31	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	SSQ1	YLR369W	1974 nt		2.31	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	PEX4	YGR133W	552 nt		2.31	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		2.31	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YLR307C-A	YLR307C-A	264 nt		2.31	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YMR181C	YMR181C	465 nt		2.31	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	NGL1	YOL042W	1092 nt		2.31	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	MRPL40	YPL173W	894 nt		2.31	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	AFT2	YPL202C	1251 nt		2.31	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YJL049W	YJL049W	1353 nt		2.31	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	CDC55	YGL190C	1581 nt		2.31	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	GCV2	YMR189W	3105 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	CBS2	YDR197W	1170 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	GUK1	YDR454C	564 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	RFA3	YJL173C	369 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YAL026C-A	YAL026C-A	438 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	ATP7	YKL016C	525 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YAL059C-A	YAL059C-A	423 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	SMD3	YLR147C	306 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	RBL2	YOR265W	321 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	CUP9	YPL177C	921 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	ALG14	YBR070C	714 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	JID1	YPR061C	906 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	ERT1	YBR239C	1590 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	SNX41	YDR425W	1878 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	FUS2	YMR232W	2034 nt		2.3	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	SRB4	YER022W	2064 nt		2.29	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	TRM2	YKR056W	1920 nt		2.29	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	DBF20	YPR111W	1695 nt		2.29	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	RPS24A	YER074W	408 nt		2.29	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		2.29	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	DYN3	YMR299C	939 nt		2.29	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	HSP10	YOR020C	321 nt		2.29	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	RRG7	YOR305W	729 nt		2.29	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	STH1	YIL126W	4080 nt		2.29	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	DNF1	YER166W	4716 nt		2.29	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	GUP1	YGL084C	1683 nt		2.28	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	STD1	YOR047C	1335 nt		2.28	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YGL039W	YGL039W	1047 nt		2.28	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	Q0144	Q0144	330 nt		2.28	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YOL134C	YOL134C	390 nt		2.28	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	HUA2	YOR284W	732 nt		2.28	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	RPC40	YPR110C	1008 nt		2.28	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	YCL023C	YCL023C	348 nt		2.28	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	FIR1	YER032W	2631 nt		2.28	□□□□□ -2.04
ATG12	P38316	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YCR099C	YCR099C	468 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	TIM11	YDR322C-A	291 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YFR054C	YFR054C	579 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YFR057W	YFR057W	456 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	ERV1	YGR029W	570 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YIL046W-A	YIL046W-A	165 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YIL068W-A	YIL068W-A	384 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	GPN3	YLR243W	819 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	ARC18	YLR370C	537 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YOR366W	YOR366W	354 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	GRX5	YPL059W	453 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	RSA1	YPL193W	1146 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SRP1	YNL189W	1629 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SPB1	YCL054W	2526 nt		2.27	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	TFC3	YAL001C	3483 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	AGE1	YDR524C	1449 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	ESA1	YOR244W	1338 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YHL044W	YHL044W	708 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YIR036W-A	YIR036W-A	402 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YKL115C	YKL115C	393 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	VPS51	YKR020W	495 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	RPS22B	YLR367W	393 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	DGK1	YOR311C	873 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SRL4	YPL033C	846 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	ANR2	YKL047W	1551 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SWR1	YDR334W	4545 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	RIM13	YMR154C	2184 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	IRA2	YOL081W	9240 nt		2.26	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	YOL098C	YOL098C	3114 nt		2.25	□□□□□ -2.05
ATG12	P38316	SLF1	YDR515W	1344 nt		2.25	□□□□□ -2.05

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