Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HIF1AQ16665 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HIF1AQ16665 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms