Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RIGQ13278 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RIGQ13278 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RIGQ13278 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RIGQ13278 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms