Protein–RNA interactions for Protein: P25044

PTP1, Tyrosine-protein phosphatase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP1P25044 YML108WYML108W 318 nt3.37□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YOR392WYOR392W 444 nt3.37□□□□□ -1.87
PTP1P25044 snR54snR54 86 nt3.37□□□□□ -1.87
PTP1P25044 MSD1YPL104W 1977 nt3.37□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YKL050CYKL050C 2769 nt3.37□□□□□ -1.87
PTP1P25044 ACK1YDL203C 1872 nt3.37□□□□□ -1.87
PTP1P25044 DAL5YJR152W 1632 nt3.37□□□□□ -1.87
PTP1P25044 ELM1YKL048C 1923 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 DSL1YNL258C 2265 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 NTF2YER009W 378 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YGL015CYGL015C 393 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 ABM1YJR108W 372 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 NNF1YJR112W 606 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YOR282WYOR282W 321 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 PHO88YBR106W 567 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YBR137WYBR137W 540 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 AIM4YBR194W 372 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 PFK26YIL107C 2484 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 KAP95YLR347C 2586 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 MSS4YDR208W 2340 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 OST1YJL002C 1431 nt3.36□□□□□ -1.87
PTP1P25044 ZDS1YMR273C 2748 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 ETP1YHL010C 1758 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 SLA1YBL007C 3735 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 UBP12YJL197W 3765 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 SQS1YNL224C 2304 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YDR149CYDR149C 708 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 SMB1YER029C 591 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 MRPL31YKL138C 396 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 BSC3YLR465C 309 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 PDR17YNL264C 1053 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YOR331CYOR331C 558 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YPL107WYPL107W 747 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 STE24YJR117W 1362 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 CIT1YNR001C 1440 nt3.35□□□□□ -1.87
PTP1P25044 TFB2YPL122C 1542 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 LST4YKL176C 2487 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 SSE2YBR169C 2082 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 RRN6YBL014C 2685 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 DSF2YBR007C 2211 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 PWP2YCR057C 2772 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 AKR1YDR264C 2295 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 ERV1YGR029W 570 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 RTS3YGR161C 792 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 MAM33YIL070C 801 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 POG1YIL122W 1056 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 MAK16YAL025C 921 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 YJR079WYJR079W 330 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 AAR2YBL074C 1068 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 AEP3YPL005W 1821 nt3.34□□□□□ -1.87
PTP1P25044 SLM2YNL047C 1971 nt3.34□□□□□ -1.88
PTP1P25044 FUS2YMR232W 2034 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 TRX3YCR083W 384 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 GCN4YEL009C 846 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 MTC3YGL226W 372 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 VMA10YHR039C-A 345 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 MCM22YJR135C 720 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 TDA8YAL064C-A 381 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 AFB1YLR040C 675 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 RNH203YLR154C 333 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 PBA1YLR199C 831 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 RPS28BYLR264W 204 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 PDP3YLR455W 915 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 IMP4YNL075W 873 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 SWC4YGR002C 1431 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 SEN54YPL083C 1404 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 NCS2YNL119W 1482 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 DAP2YHR028C 2457 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 SDS23YGL056C 1584 nt3.33□□□□□ -1.88
PTP1P25044 snR59snR59 78 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 GPP2YER062C 753 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 YGL039WYGL039W 1047 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 YKL118WYKL118W 312 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 PIR1YKL164C 1026 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 ECM4YKR076W 1113 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 YMR087WYMR087W 855 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 YNL043CYNL043C 321 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 GRE2YOL151W 1029 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 YOR082CYOR082C 342 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 SEC59YMR013C 1560 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 TPD3YAL016W 1908 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 RNR1YER070W 2667 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 RPN2YIL075C 2838 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 CHD1YER164W 4407 nt3.32□□□□□ -1.88
PTP1P25044 ISM1YPL040C 3009 nt3.31□□□□□ -1.88
PTP1P25044 MFA1YDR461W 111 nt3.31□□□□□ -1.88
PTP1P25044 SLD5YDR489W 885 nt3.31□□□□□ -1.88
PTP1P25044 SEC53YFL045C 765 nt3.31□□□□□ -1.88
PTP1P25044 LIF1YGL090W 1266 nt3.31□□□□□ -1.88
PTP1P25044 YIR040CYIR040C 333 nt3.31□□□□□ -1.88
PTP1P25044 YKL069WYKL069W 543 nt3.31□□□□□ -1.88
PTP1P25044 PAI3YMR174C 207 nt3.31□□□□□ -1.88
PTP1P25044 YOL134CYOL134C 390 nt3.31□□□□□ -1.88
PTP1P25044 SHG1YBR258C 429 nt3.31□□□□□ -1.88
PTP1P25044 RAD2YGR258C 3096 nt3.31□□□□□ -1.88
PTP1P25044 EPO1YMR124W 2832 nt3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.9 ms