Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CFAP69A5D8W1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CFAP69A5D8W1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms