Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC78A2IDD5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC78A2IDD5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC78A2IDD5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.9 ms