Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCRT1Q9BWW7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCRT1Q9BWW7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms