Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 YMR141CYMR141C 309 nt2.44□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 CSH1YBR161W 1131 nt2.44□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 CLB4YLR210W 1383 nt2.44□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 TOP1YOL006C 2310 nt2.44□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 ROY1YMR258C 1662 nt2.43□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 NRP1YDL167C 2160 nt2.43□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 YFH1YDL120W 525 nt2.43□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 LSM1YJL124C 519 nt2.43□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt2.43□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 RIM13YMR154C 2184 nt2.43□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 CLU1YMR012W 3834 nt2.43□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 PHR1YOR386W 1698 nt2.42□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 RMP1YLR145W 606 nt2.41□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 CDC73YLR418C 1182 nt2.41□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 YOR114WYOR114W 885 nt2.41□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 YLR345WYLR345W 1530 nt2.41□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 YOL057WYOL057W 2136 nt2.41□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 GNT1YOR320C 1476 nt2.41□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 LCB4YOR171C 1875 nt2.4□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 ISF1YMR081C 1017 nt2.4□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 CPR8YNR028W 927 nt2.4□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 NAN1YPL126W 2691 nt2.4□□□□□ -2.02
YPK9Q12697 NPL6YMR091C 1308 nt2.4□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 RPS18AYDR450W 441 nt2.39□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 TMA22YJR014W 597 nt2.39□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 COQ9YLR201C 783 nt2.39□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.39□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 MDS3YGL197W 4464 nt2.39□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 ISW1YBR245C 3390 nt2.39□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 IST1YNL265C 897 nt2.39□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 CFT2YLR115W 2580 nt2.38□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 HDA2YDR295C 2025 nt2.38□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 MDM10YAL010C 1482 nt2.38□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 APM1YPL259C 1428 nt2.38□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 AGC1YPR021C 2709 nt2.38□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 TRZ1YKR079C 2517 nt2.37□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 ART10YLR392C 1557 nt2.37□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 PHO2YDL106C 1680 nt2.37□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 YHR145CYHR145C 357 nt2.37□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 SPO20YMR017W 1194 nt2.37□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 HUA2YOR284W 732 nt2.37□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 UTP21YLR409C 2820 nt2.37□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 UTP13YLR222C 2454 nt2.36□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 TVP15YDR100W 432 nt2.36□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 COS6YGR295C 1146 nt2.36□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 YHI9YHR029C 885 nt2.36□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.36□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 ATG34YOL083W 1239 nt2.36□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 RPS30BYOR182C 192 nt2.36□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 TRX1YLR043C 312 nt2.35□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 VPS35YJL154C 2835 nt2.35□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.34□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 YGR011WYGR011W 327 nt2.34□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 OKP1YGR179C 1221 nt2.34□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 VMA22YHR060W 546 nt2.34□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 REC102YLR329W 795 nt2.34□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 OSW5YMR148W 447 nt2.34□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 TSR4YOL022C 1227 nt2.34□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 DSE3YOR264W 1293 nt2.34□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 YDL199CYDL199C 2064 nt2.34□□□□□ -2.03
YPK9Q12697 YCR050CYCR050C 309 nt2.33□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 YJR023CYJR023C 402 nt2.33□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 UBP3YER151C 2739 nt2.33□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 ALB1YJL122W 528 nt2.33□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 YNL035CYNL035C 1170 nt2.33□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 EPO1YMR124W 2832 nt2.33□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 ALG1YBR110W 1350 nt2.32□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 OCT1YKL134C 2319 nt2.32□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 FIG4YNL325C 2640 nt2.32□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 UBC6YER100W 753 nt2.32□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 TPM2YIL138C 486 nt2.32□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 YKR047WYKR047W 306 nt2.32□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 ATP11YNL315C 957 nt2.32□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 ATP17YDR377W 306 nt2.31□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.31□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 SEC65YML105C 822 nt2.31□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 RPS0BYLR048W 759 nt2.3□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 NNT1YLR285W 786 nt2.3□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 YML003WYML003W 873 nt2.3□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 YER085CYER085C 522 nt2.29□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 YIL102CYIL102C 306 nt2.29□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 YBL096CYBL096C 309 nt2.29□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 YPR027CYPR027C 834 nt2.29□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 PEX5YDR244W 1839 nt2.29□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 RRI1YDL216C 1323 nt2.29□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 MSM1YGR171C 1728 nt2.29□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 SSF1YHR066W 1362 nt2.28□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 YDR203WYDR203W 318 nt2.28□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 SYH1YPL105C 2550 nt2.28□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 IRE1YHR079C 3348 nt2.28□□□□□ -2.04
YPK9Q12697 PKR1YMR123W 369 nt2.27□□□□□ -2.05
YPK9Q12697 RNA1YMR235C 1224 nt2.27□□□□□ -2.05
YPK9Q12697 PKH3YDR466W 2697 nt2.27□□□□□ -2.05
YPK9Q12697 UBX3YDL091C 1368 nt2.27□□□□□ -2.05
YPK9Q12697 BDP1YNL039W 1785 nt2.27□□□□□ -2.05
YPK9Q12697 RAD50YNL250W 3939 nt2.27□□□□□ -2.05
YPK9Q12697 TOR2YKL203C 7425 nt2.27□□□□□ -2.05
YPK9Q12697 RRF1YHR038W 693 nt2.26□□□□□ -2.05
YPK9Q12697 YJL015CYJL015C 285 nt2.26□□□□□ -2.05
YPK9Q12697 YBP1YBR216C 2025 nt2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 194.1 ms