Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 RED1YLR263W 2484 nt3.29□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 AEP1YMR064W 1557 nt3.29□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YMR046CYMR046C 1323 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 RPA190YOR341W 4995 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YDL050CYDL050C 372 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YFL015CYFL015C 495 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 BTN2YGR142W 1233 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 MRPL9YGR220C 810 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YLL037WYLL037W 381 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YLR050CYLR050C 486 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YOR387CYOR387C 621 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 YBR053CYBR053C 1077 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 XRN1YGL173C 4587 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 HEF3YNL014W 3135 nt3.28□□□□□ -1.88
RIM20Q12033 NGG1YDR176W 2109 nt3.28□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 VPS30YPL120W 1674 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 GYP7YDL234C 2241 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 SRP1YNL189W 1629 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 VAB2YEL005C 849 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 GOS1YHL031C 672 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YKR011CYKR011C 1062 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YML037CYML037C 1023 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 TVP18YMR071C 504 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YSF3YNL138W-A 258 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 PFY1YOR122C 381 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 MGE1YOR232W 687 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 ARL1YBR164C 552 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 ARP5YNL059C 2268 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 CST9YLR394W 1449 nt3.27□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 MPS1YDL028C 2295 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 SIN3YOL004W 4611 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 ORC1YML065W 2745 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YGR283CYGR283C 1026 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 SPO11YHL022C 1197 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 SDP1YIL113W 630 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 SDO1YLR022C 753 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YPT6YLR262C 648 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 GCY1YOR120W 939 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 JIP5YPR169W 1479 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 MUS81YDR386W 1899 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 MSH2YOL090W 2895 nt3.26□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 FMN1YDR236C 657 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 RTT105YER104W 627 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YHR212CYHR212C 336 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YJL032WYJL032W 315 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YAR060CYAR060C 336 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 NDL1YLR254C 570 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 JIP3YLR331C 378 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 PEX27YOR193W 1131 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 SPR2YOR214C 711 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 snR35snR35 204 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 VPS3YDR495C 3036 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YGR067CYGR067C 2415 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 PEX5YDR244W 1839 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 AVT5YBL089W 1380 nt3.25□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 VPS38YLR360W 1320 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 TSC11YER093C 4293 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 GYL1YMR192W 2163 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 STE2YFL026W 1296 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YGR126WYGR126W 693 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YKT6YKL196C 603 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 PRM6YML047C 1059 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 snR24snR24 89 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 PEX1YKL197C 3132 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 SYO1YDL063C 1863 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 TPO5YKL174C 1857 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 NOP56YLR197W 1515 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 HBT1YDL223C 3141 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 FAR1YJL157C 2493 nt3.24□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 SMC2YFR031C 3513 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 RAX2YLR084C 3663 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 RSE1YML049C 4086 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YCG1YDR325W 3108 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 snR83snR83 306 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 VMA10YHR039C-A 345 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YKL115CYKL115C 393 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 FLO9YAL063C 3969 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 ATG10YLL042C 504 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 SUB1YMR039C 879 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YNL109WYNL109W 546 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 MER1YNL210W 813 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 PDR17YNL264C 1053 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 SME1YOR159C 285 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YLR278CYLR278C 4026 nt3.23□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 MUB1YMR100W 1863 nt3.22□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 MYO5YMR109W 3660 nt3.22□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 FLO1YAR050W 4614 nt3.22□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 VAC14YLR386W 2643 nt3.22□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YDR431WYDR431W 312 nt3.22□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 YGL039WYGL039W 1047 nt3.22□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 RPB9YGL070C 369 nt3.22□□□□□ -1.89
RIM20Q12033 RPS22AYJL190C 393 nt3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.8 ms