Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNE2O96020 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCNE2O96020 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms