Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SETBP1Q9Y6X0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
SETBP1Q9Y6X0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
SETBP1Q9Y6X0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.44■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
SETBP1Q9Y6X0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
SETBP1Q9Y6X0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
SETBP1Q9Y6X0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SETBP1Q9Y6X0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SETBP1Q9Y6X0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SETBP1Q9Y6X0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SETBP1Q9Y6X0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
SETBP1Q9Y6X0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
SETBP1Q9Y6X0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SETBP1Q9Y6X0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SETBP1Q9Y6X0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SETBP1Q9Y6X0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SETBP1Q9Y6X0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SETBP1Q9Y6X0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SETBP1Q9Y6X0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SETBP1Q9Y6X0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SETBP1Q9Y6X0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SETBP1Q9Y6X0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SETBP1Q9Y6X0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SETBP1Q9Y6X0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SETBP1Q9Y6X0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
SETBP1Q9Y6X0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SETBP1Q9Y6X0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SETBP1Q9Y6X0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SETBP1Q9Y6X0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SETBP1Q9Y6X0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SETBP1Q9Y6X0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
SETBP1Q9Y6X0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SETBP1Q9Y6X0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SETBP1Q9Y6X0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SETBP1Q9Y6X0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SETBP1Q9Y6X0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms